Chùa cũ có nhiều tên gọi khác nhau: Vào thời Lê, chùa có tên là “Chùa Bồ Đà” vì chùa thờ Phật, Bồ Tát luôn đem lòng từ bi cứu khổ cứu nạn, phổ độ chúng sinh.

          Gọi là Bán Thiên Tự hay Chùa Bán Mái, vì chùa tọa lạc ở lưng chừng trời, một nửa ngôi chùa ở ngoài trời, còn một nửa trong hang động. Gọi là “Thanh Long Động” vì chùa ở trong động của dãy núi Thanh Long nằm ở phía Đông chùa Hoa Yên.

          Ở vị trí địa thế độc đáo, không gian hẹp, đường vào chùa men theo vách đá chênh vênh, kiến trúc chùa bốn gian đơn giản, hai hồi chùa là vách đá, tường bao phía trước là những tấm gỗ ghép lại và có hai cửa sổ chắn song hướng Nam. Kích thước Chùa: Chiều dài 9,6m, chiều sâu 1,7m, chiều cao 2,3m và bán mái là 0,9m.